home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Inside Indy 1993 / Inside Indy 1993.iso / demos / CHEM / ribbon / data / his.notes < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1993-06-23  |  680 b   |  30 lines
  1.  
  2.             histidine model
  3.  
  4.     Date Files:
  5.  
  6.     The single histidine from the protein ubiquitin was filtered
  7.     out of the *.pdb file:
  8.         grep HIS ubiq.pdb > his.pdb
  9.  
  10.     A set of spheres color coded by atom type was generated: 
  11.         pdb-atom-sph his.pdb his.sph
  12.  
  13.     A set of split bonds colored by atom type was generated: 
  14.         sph-bond his.sph his.cyl
  15.  
  16.     The *.atoms file consists of only one filename:
  17.         ls his.sph > his.atoms
  18.  
  19.     The *.bonds file consists of only one filename:
  20.         ls his.cyl > his.bonds
  21.  
  22.     The *.atoms file consists of only one filename:
  23.         ls his.sph > his.atoms
  24.  
  25.     The *.model file was generated:
  26.         pdb-model his.pdb his.model
  27.  
  28.     The ball-&-stick model is now ready for display.
  29.         10
  30.